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生命工学実習 Quiz 1〜3

生命工学実習 Quiz 1〜3
24問 • 2年前
  • 福田千紘
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    問題一覧

  • 1

    Miniprep(アルカリーSDS法)において、Solution2を加えると液が透明になり、かつ、粘性が高まる。その理由は何か。

    大腸菌のタンパク質や、壊れた細胞、染色体などが絡まり、大きな複合体を形成し、それをSDS(界面活性剤)がコートするから

  • 2

    実習で行った Miniprep の手順5のサンプルを激しく撹枠すると最終的に得られるプラスミドはどうなるか。

    プラスミドにニックが入り、閉環状DNAから、開環状DNAや直鎖状DNAになる。

  • 3

    プラスミドにはどのような形態があるか?

    form1 閉環状DNA form2開環状DNA form3 直鎖状DNA

  • 4

    アガロースゲルの電気泳動でDNAがサイズの違いによって分離できるのはなぜか?

    DNAはマイナスに帯電しているため、プラス側に引っ張られる。このとき、分子量の大きい長い分子ほどゲルとの相互作用が大きくなり、移動距離が小さくなるため。

  • 5

    DNA溶液とローディングダイを混ぜたものはなぜアガロースゲルのウエルにいれると沈むの か?

    ローディングダイには、比重が大きくなるようにグリセロールなどが含まれているため。

  • 6

    エチジウムブロマイド(今回は代替品のGeIRed)の入ったアガロースゲルで電気泳動後、紫外線(UV)をあてるとDNAが見えるのはなぜか?

    エチジウムブロマイドはDNAの2本鎖の間に入り込み(インターカレント)、DNAが吸収した光エネルギーを受け取ることで励起状態になるため。

  • 7

    200マイクロリットルの量のDNA溶液があるとする。これをエタノール沈殿するときのプロトコール(手順)を書きなさい。

    1. 試薬をDNA:3M酢酸ナトリウム:エタノール=1:1/10:3で混ぜ、キャリアとしてグリコーゲンを加える。, 2. 遠心し、DNAを凝集させる。, 3. 上清を取り除き、沈殿にエタノールを加え、もう一度遠心する。, 4. 3の操作を2〜3回繰り返し、最後にエタノールをしっかり除去する。

  • 8

    エタノール沈殿でなぜDNAは沈殿するのか?

    DNAはエタノールに溶けないため、沈澱しやすい状態になっており、そこに一価の陽イオンを加えると、DNAの電荷が消えて凝集し、沈澱するから。

  • 9

    エタノール沈殿後 70%エタノールで洗うのはなぜか?また、なぜ水で洗ってはいけないのか?

    DNAはエタノールに溶けないため、不純物のみ除去することができるが、水には溶けてしまうため、DNAも一緒に除去されてしまうから。

  • 10

    DNA 実験に使用するチップやチューブは使用前にオートクレーブ(蒸気滅菌)を行うことが多い。この理由を考えよ。

    実験器具に付着しているDNaseを失活させるため。

  • 11

    DNAを扱う際は素手ではなく手袋をするが、その理由を述べよ。

    皮膚や汗にDNase(DNA分解酵素)が含まれているから。

  • 12

    制限酵素はどのような生物に由来するものか

    細菌

  • 13

    制限酵素でDNAの消化をおこなうとき反応条件で重要な条件を挙げよ。

    それぞれの制限酵素に適切な塩濃度に設定すること。

  • 14

    どのような方法で目的のプラスミドが導入された大腸菌を得るのか?

    DNAを導入しやすくした大腸菌であるコンピテントセルに、プラスミドをtransformationすることで、プラスミドが導入された大腸菌が得られる。

  • 15

    大腸菌からプラスミドを精製する方法であるアルカリーSDS法の原理を述べよ。

    強アルカリ性と界面活性剤(SDS)によって菌体を破壊した後、溶液を中性に戻ることで、ゲノムDNAやタンパク質は変性して複合体を形成するが、プラスミドは再会合するため、遠心分離によって上清に残ったプラスミドのみを回収することができる。

  • 16

    目的のプラスミドが導入された大腸菌を保存する方法を述べよ。

    寒天培地:乾燥を防ぎ4℃で一週間保存できる, 液体培地:4℃で一週間保存できる

  • 17

    大腸菌の培養に用いる培地の名前を述べよ。

    LB培地

  • 18

    DNAのライゲーションにもちいる酵素の名を述べよ。また、ライゲーション反応を行うときの温度を述べよ。

    T4リガーゼ, 16℃

  • 19

    制限酵素を失活させる方法を二つ挙げよ。また、なぜ失活するのか述べよ。

    加熱処理:熱によってタンパク質が変性するから, フェノール処理:フェノールによってタンパク質が変性するから

  • 20

    制限酵素を反応液に多く入れすぎると本来認識しないはずの配列を認識してDNAを切断することがある。そのような活性をなんと呼ぶのか?また、その主たる原因は何か?

    Star活性, 低イオン強度(25mM以下) 高pH(8.0以下)

  • 21

    プラスミドにはクローニングベクターと発現ベクターがある。それぞれの使用する目的は何か?

    クローニングベクター:標的遺伝子を大腸菌内で増やすことを目的とする。, 発現ベクター:標的遺伝子を、細胞に入れた際に強制的に発現させることを目的とする。

  • 22

    DNAを導入しやすくした大腸菌のことを何と呼ぶか?また、大腸菌の形質転換の方法を二つ 挙げよ。

    Heat shock, Electroporation(エレクトロポレーション)

  • 23

    大腸菌を液体培地の中で培養することと寒天培地で培養することの目的の違いを述べよ。

    液体培地:コロニー由来の大腸菌を増殖させることを目的とする。 寒天培地:単一コロニーを得ることを目的とする。

  • 24

    外来遺伝子を導入した大腸菌をそのまま流しに廃棄してはいけない理由を述べよ。廃棄するにはどうしたらよいのか述べよ。

    遺伝子組換え生物は、生態系の破壊、人や動植物への感染、産業被害等を引き起こす可能性があるため。, オートクレーブ(121℃、2気圧、20分以上)、あるいは消毒薬を使用し、不活化してから廃棄する。

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    問題一覧

  • 1

    Miniprep(アルカリーSDS法)において、Solution2を加えると液が透明になり、かつ、粘性が高まる。その理由は何か。

    大腸菌のタンパク質や、壊れた細胞、染色体などが絡まり、大きな複合体を形成し、それをSDS(界面活性剤)がコートするから

  • 2

    実習で行った Miniprep の手順5のサンプルを激しく撹枠すると最終的に得られるプラスミドはどうなるか。

    プラスミドにニックが入り、閉環状DNAから、開環状DNAや直鎖状DNAになる。

  • 3

    プラスミドにはどのような形態があるか?

    form1 閉環状DNA form2開環状DNA form3 直鎖状DNA

  • 4

    アガロースゲルの電気泳動でDNAがサイズの違いによって分離できるのはなぜか?

    DNAはマイナスに帯電しているため、プラス側に引っ張られる。このとき、分子量の大きい長い分子ほどゲルとの相互作用が大きくなり、移動距離が小さくなるため。

  • 5

    DNA溶液とローディングダイを混ぜたものはなぜアガロースゲルのウエルにいれると沈むの か?

    ローディングダイには、比重が大きくなるようにグリセロールなどが含まれているため。

  • 6

    エチジウムブロマイド(今回は代替品のGeIRed)の入ったアガロースゲルで電気泳動後、紫外線(UV)をあてるとDNAが見えるのはなぜか?

    エチジウムブロマイドはDNAの2本鎖の間に入り込み(インターカレント)、DNAが吸収した光エネルギーを受け取ることで励起状態になるため。

  • 7

    200マイクロリットルの量のDNA溶液があるとする。これをエタノール沈殿するときのプロトコール(手順)を書きなさい。

    1. 試薬をDNA:3M酢酸ナトリウム:エタノール=1:1/10:3で混ぜ、キャリアとしてグリコーゲンを加える。, 2. 遠心し、DNAを凝集させる。, 3. 上清を取り除き、沈殿にエタノールを加え、もう一度遠心する。, 4. 3の操作を2〜3回繰り返し、最後にエタノールをしっかり除去する。

  • 8

    エタノール沈殿でなぜDNAは沈殿するのか?

    DNAはエタノールに溶けないため、沈澱しやすい状態になっており、そこに一価の陽イオンを加えると、DNAの電荷が消えて凝集し、沈澱するから。

  • 9

    エタノール沈殿後 70%エタノールで洗うのはなぜか?また、なぜ水で洗ってはいけないのか?

    DNAはエタノールに溶けないため、不純物のみ除去することができるが、水には溶けてしまうため、DNAも一緒に除去されてしまうから。

  • 10

    DNA 実験に使用するチップやチューブは使用前にオートクレーブ(蒸気滅菌)を行うことが多い。この理由を考えよ。

    実験器具に付着しているDNaseを失活させるため。

  • 11

    DNAを扱う際は素手ではなく手袋をするが、その理由を述べよ。

    皮膚や汗にDNase(DNA分解酵素)が含まれているから。

  • 12

    制限酵素はどのような生物に由来するものか

    細菌

  • 13

    制限酵素でDNAの消化をおこなうとき反応条件で重要な条件を挙げよ。

    それぞれの制限酵素に適切な塩濃度に設定すること。

  • 14

    どのような方法で目的のプラスミドが導入された大腸菌を得るのか?

    DNAを導入しやすくした大腸菌であるコンピテントセルに、プラスミドをtransformationすることで、プラスミドが導入された大腸菌が得られる。

  • 15

    大腸菌からプラスミドを精製する方法であるアルカリーSDS法の原理を述べよ。

    強アルカリ性と界面活性剤(SDS)によって菌体を破壊した後、溶液を中性に戻ることで、ゲノムDNAやタンパク質は変性して複合体を形成するが、プラスミドは再会合するため、遠心分離によって上清に残ったプラスミドのみを回収することができる。

  • 16

    目的のプラスミドが導入された大腸菌を保存する方法を述べよ。

    寒天培地:乾燥を防ぎ4℃で一週間保存できる, 液体培地:4℃で一週間保存できる

  • 17

    大腸菌の培養に用いる培地の名前を述べよ。

    LB培地

  • 18

    DNAのライゲーションにもちいる酵素の名を述べよ。また、ライゲーション反応を行うときの温度を述べよ。

    T4リガーゼ, 16℃

  • 19

    制限酵素を失活させる方法を二つ挙げよ。また、なぜ失活するのか述べよ。

    加熱処理:熱によってタンパク質が変性するから, フェノール処理:フェノールによってタンパク質が変性するから

  • 20

    制限酵素を反応液に多く入れすぎると本来認識しないはずの配列を認識してDNAを切断することがある。そのような活性をなんと呼ぶのか?また、その主たる原因は何か?

    Star活性, 低イオン強度(25mM以下) 高pH(8.0以下)

  • 21

    プラスミドにはクローニングベクターと発現ベクターがある。それぞれの使用する目的は何か?

    クローニングベクター:標的遺伝子を大腸菌内で増やすことを目的とする。, 発現ベクター:標的遺伝子を、細胞に入れた際に強制的に発現させることを目的とする。

  • 22

    DNAを導入しやすくした大腸菌のことを何と呼ぶか?また、大腸菌の形質転換の方法を二つ 挙げよ。

    Heat shock, Electroporation(エレクトロポレーション)

  • 23

    大腸菌を液体培地の中で培養することと寒天培地で培養することの目的の違いを述べよ。

    液体培地:コロニー由来の大腸菌を増殖させることを目的とする。 寒天培地:単一コロニーを得ることを目的とする。

  • 24

    外来遺伝子を導入した大腸菌をそのまま流しに廃棄してはいけない理由を述べよ。廃棄するにはどうしたらよいのか述べよ。

    遺伝子組換え生物は、生態系の破壊、人や動植物への感染、産業被害等を引き起こす可能性があるため。, オートクレーブ(121℃、2気圧、20分以上)、あるいは消毒薬を使用し、不活化してから廃棄する。