컴퓨터를 종료하기전 ( ) 하고 종료한다

( )는 유닉스라는 컴퓨터 운영체제를 개인용 컴퓨터에서 사용할 수 있도록 제작된 ( ) 운영체제를 사용한다.

리눅스 컴퓨터 환경 설치를 위해서 새로운 컴퓨터에 리눅스의 한 종류인 ( )를 설치한다.

컴퓨터를 구매한다는 것은 컴퓨터라는 (1)와 운영체제라는 (2)를 함께 구매하게 된다.

윈도우와 리눅스 운영체제를 함께 설치 후, 필요에 따라 2가지 운영체제 중 하나를 선택하여 컴퓨터를 사용

리눅스 운영체제를 조그만한 ( )에 저장하고, 이것을 컴퓨터에 연결하여 리눅스로 부팅하여 컴퓨터를 사용.

이것을 윈도우 컴퓨터에 설치하고 이것에 리눅스 컴퓨터를 설치해 리눅스를 사용

우리 수업에서 많이 사용한 리눅스 웹사이트

우리가 이해할 수 있는 문자 정보

문자정보가 있는 파일

리눅스 터미널의 편집기 중 하나

윈도우 컴퓨터에서 사용할 수 있고 맥컴퓨터와 리눅스 컴퓨터에서도 사용할 수 있는 편집기

통계적인 분석을 도와주는 거대한 소프트웨어 플랫폼

R의 편의성 증대에 지대한 영향을 준 프로그램

명령어의 3가지 구성요소

옵션 다음에 따라오는 인자

긴 옵션과 옵션 인자 사이는 빈칸을 두든지 빈칸을 두지 않는 경우 ( )를 이용하여 긴옵션 인자를 사용한다

컴퓨터에 정보를 저장되는 기본 단위

파일에 대한 권한 3가지

파일의 내용을 변경하지 않고 볼 수 있는 권한

파일의 내용을 변경하거나 파일 자체를 삭제할 수 있는 권한

파일을 명령어로 컴퓨터에 실행할 수 있도록 하는 권한

파일에 접근할 수 있는 사용자 3가지

파일 권한 변경에 관한 명령어

r--

-w-

--x

여러 명령어를 저장해 한번에 실행할 수 있는 파일

쉘스크립트를 실행하는 명령어

크기 305mm x 244mm인 표준 메인보드 규격으로, 대부분의 데스크탑 컴퓨터에서 사용.

크기 244mm x 244mm으로 ATX보다 작은 크기지만 대부분의 기능을 지원.

크기 170mm x 170mm의 매우 작은 크기로, 소형 컴퓨터에 적합.

크기 305mm x 330mm으로 ATX보다 더 큰 크기로, 고급형 워크스테이션이나 서버용으로 사용되어 높은 확장성과 성능을 제공.

컴퓨터의 핵심 부품 중 하나로, 모든 하드웨어가 연결되는 중심 회로 기판

CPU가 장착되는 자리

RAM을 설치하는 공간

그래픽 카드, 사운드 카드, 네트워크 카드 등 다양한 확장 카드를 장착할 수 있는슬롯

하드 드라이브(HDD), SSD와 같은 저장 장치를 연결하는 포트

CPU와 메모리, 그래픽 카드, 저장 장치 등의 통신을 관리하는 컨트롤러

컴퓨터의 각 구성 요소에 적절한 전력을 공급하는 장치

컴퓨터의 두뇌 역할을 하는 핵심 부품

컴퓨터의 메모리 중 하나로, 데이터를 일시적으로 저장하고, CPU가 빠르게 접근할 수 있도록 지원하는 역할

가장 일반적이고 많이 사용되는 쿨러 유형으로, 히트싱크와 팬을 사용하여 CPU의 열을 공기로 방출합니다.

액체(주로 냉각수)를 사용하여 CPU의 열을 제거하는 방식으로, 공랭식 쿨러보다 더 효율적인 냉각 성능을 제공

CPU와 CPU 쿨러 사이에 발라서 열전도 효율을 높여주는 물질

메인보드의 확장 슬롯에 장착하여 컴퓨터에 새로운 기능을 추가하거나 성능을 향상시키는 하드웨어

리눅스 커널을 기반으로 한 오픈 소스 운영체제(OS)

컴퓨터에서 파일의 위치

우분투의 파일탐색기

컴퓨터의 운영체제마다 컴퓨터는 필요한 파일을 저장하는 방법이 서로 다르다. 컴퓨터가 컴퓨터 파일을 저장하는 방법의 차이

폴더 들어 있는 파일들을 나열해 주는 명령어.

리눅스에서 폴더 이름

리눅스에서 컴퓨터의 모든 정보를 저장하는 가장 큰 폴더

파일 위치를 루트를 시작으로 표시하는 방식

루트로 시작하지 않는 파일 위치를 나타내는 문자열

현재 사용자가 있는 위치를 알려주는 명령어

사용자들의 홈폴더들을 위한 상위폴더이다.

수퍼사용자 또는 루트사용자의 홈폴더이다.

컴퓨터 설정 관련 파일들을 볼 수 있는 폴더

컴퓨터 동작을 위한 기본적인 명령어들을 위한 폴더이다.

시스템 명령어들을 위한 폴더이다.

응용프로그램들이 설치되는 폴더이다.

명령어들이 동작할 수 있도록 도와주는 라이브러리들이 있는 폴더이다.

임시 파일들이 생성 및 삭제되는 폴더이다.

시스템 운용 중에 생성되는 임시 파일들로 파일의 크기가 시시각각 변하는 파일들을 위한 폴더이 다.

컴퓨터의 주변 장치를 연결시켜 주는 파일로 구성되는 폴더이다.

텍스트 파일의 내용을 화면에 출력하는 명령어

텍스트 파일의 내용을 페이지 단위로 보여주는 명령어

more 명령어와 같은 기능과 함께 부가 기능을 가지는 명령어로 more보다 더 유용

인터넷 URL을 사용하여 파일을 내려받는 명령어

폴더 만드는 명령어

위치 이동하는 명령어

less에서 아래로 스크롤하는 키

less에서 위로 스크롤 하는 키

less에서 텍스트파일 처음으로 가는 키

less에서 텍스트 파일 가장 아래로 가는 키

컴퓨터 사용자인 사람이 이해할 수 있는 언어로 구성된 파일

컴퓨터가 실행을 하는 방식은 소스 파일을 한 줄씩 읽고 이해하는대로 실행하는 방식

소스 파일을 컴퓨터가 이해할수 있도록 기계어 파일로 변환한 후 컴퓨터가 이 기계어를 실행하는 방법

컴파일하는 명령어

미국 의학도서관(National Library of Medicine) 산하 기관으로 생물학과 의학 관련 정보를 보관, 관리, 배포한다.

미국의 NCBI와 더불어 유럽에서는 ( )이라는 웹사이트가 유럽의 연구 기관들이 애용하는 생물학 관련 데이터베이스를 제공한다.

서열 자체와 함께 서열에 대한 부가 정보가 텍스트 형식으로 저장되어 있는 파일 형식

서열 자체에 대한 정보만 있는 파일 형식

서열에 대한 주석 정보를 주로 저장하는 파일 형식

생물 종들 사이의 진화적 관계

대부분의 리눅스 명령어는 처리된 결과를 화면에 출력

리눅스 명령어는 기본적으로 키보드로부터 입력을 받음

하나의 명령어 출력 결과를 다른 명령어의 입력으로 전달하는 기능

시퀀싱 결과인 DNA 염기 서열

k-mer 노드들간의 연결된 그래프

오버랩 그래프에서 genome path를 찾는 방법

드브로인 그래프의 각 노드를 한 번씩만 방문하는 길

복잡할 수 있는 유전체 조립 결과를 그래프로 된 정보 형태인 그림으로 보기 위하여 ( )라는 프로그램을 사용

다양한 유전체 주석 도구 중에서 ( )을 이용한 비슷한 유전자가 있는 참고 유전체를 사용하여새로 조립된 유전체를 조립할 수 있다.

유전체 뷰어 웹사이트

유전체 조립 명령어

DNA 분자의 염기 서열을 결정하는 과정

FASTQ 파일에 있는 모든 서열의 첫번째 위치부터 각각 위치에서의 염기의 질의 평균을 계산하여 이모지 아이콘으로 보여준다.

서열을 자르는 도구